En 1271, le Khanat mongol baptisa son Etat Yuan, unifia la Chine en 1279 et créa un pouvoir central plaçant à nouveau toutes les régions et toutes les communautés ethniques de la Chine sous une juridiction unifiée, comme sous les dynasties des Han(206 av. J.-C.-220) et des Tang (618-907). Le Tibet était alors une région administrative sous la juridiction directe des autorités centrales de la dynastie des Yuan qui régnait sur la Chine. L’empereur de la dynastie des Yuan mit sur pied le Xuanzhengyuan (le Conseil des affaires politiques) chargé de diriger les affaires militaires et politiques de la région du Tibet.